Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC5A3P53794 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A3P53794 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms