Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HK3P52790 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HK3P52790 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HK3P52790 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HK3P52790 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HK3P52790 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HK3P52790 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HK3P52790 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HK3P52790 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HK3P52790 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HK3P52790 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HK3P52790 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HK3P52790 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HK3P52790 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HK3P52790 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HK3P52790 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HK3P52790 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HK3P52790 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HK3P52790 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HK3P52790 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HK3P52790 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HK3P52790 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HK3P52790 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HK3P52790 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HK3P52790 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HK3P52790 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HK3P52790 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HK3P52790 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HK3P52790 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HK3P52790 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HK3P52790 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HK3P52790 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HK3P52790 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HK3P52790 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HK3P52790 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HK3P52790 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HK3P52790 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HK3P52790 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HK3P52790 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HK3P52790 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HK3P52790 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HK3P52790 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HK3P52790 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HK3P52790 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HK3P52790 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HK3P52790 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HK3P52790 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HK3P52790 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HK3P52790 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HK3P52790 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HK3P52790 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HK3P52790 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HK3P52790 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HK3P52790 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HK3P52790 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HK3P52790 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HK3P52790 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HK3P52790 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HK3P52790 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HK3P52790 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HK3P52790 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HK3P52790 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HK3P52790 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HK3P52790 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
HK3P52790 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HK3P52790 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HK3P52790 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HK3P52790 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HK3P52790 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HK3P52790 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HK3P52790 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HK3P52790 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HK3P52790 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HK3P52790 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HK3P52790 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HK3P52790 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HK3P52790 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HK3P52790 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HK3P52790 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HK3P52790 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HK3P52790 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HK3P52790 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HK3P52790 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HK3P52790 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HK3P52790 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HK3P52790 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HK3P52790 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HK3P52790 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HK3P52790 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HK3P52790 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HK3P52790 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HK3P52790 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HK3P52790 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HK3P52790 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HK3P52790 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HK3P52790 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HK3P52790 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HK3P52790 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HK3P52790 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HK3P52790 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms