Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAP1GDS1P52306 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAP1GDS1P52306 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms