Protein–RNA interactions for Protein: P51955

NEK2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK2P51955 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK2P51955 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK2P51955 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK2P51955 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK2P51955 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK2P51955 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK2P51955 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK2P51955 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK2P51955 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK2P51955 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK2P51955 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK2P51955 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK2P51955 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEK2P51955 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK2P51955 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK2P51955 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK2P51955 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK2P51955 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK2P51955 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK2P51955 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK2P51955 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK2P51955 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK2P51955 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK2P51955 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK2P51955 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK2P51955 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK2P51955 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK2P51955 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK2P51955 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK2P51955 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK2P51955 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK2P51955 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK2P51955 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK2P51955 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK2P51955 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK2P51955 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK2P51955 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK2P51955 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK2P51955 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK2P51955 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK2P51955 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK2P51955 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK2P51955 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK2P51955 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK2P51955 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK2P51955 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK2P51955 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK2P51955 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK2P51955 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK2P51955 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK2P51955 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK2P51955 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK2P51955 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK2P51955 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK2P51955 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK2P51955 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK2P51955 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK2P51955 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEK2P51955 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK2P51955 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK2P51955 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK2P51955 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK2P51955 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK2P51955 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK2P51955 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK2P51955 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK2P51955 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK2P51955 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK2P51955 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK2P51955 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK2P51955 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK2P51955 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK2P51955 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK2P51955 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK2P51955 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK2P51955 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK2P51955 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK2P51955 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK2P51955 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK2P51955 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK2P51955 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK2P51955 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK2P51955 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK2P51955 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK2P51955 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK2P51955 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK2P51955 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK2P51955 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK2P51955 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK2P51955 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK2P51955 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK2P51955 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK2P51955 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK2P51955 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK2P51955 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK2P51955 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK2P51955 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK2P51955 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK2P51955 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK2P51955 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms