Protein–RNA interactions for Protein: P51793

CLCN4, H(+)/Cl(-) exchange transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN4P51793 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLCN4P51793 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCN4P51793 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLCN4P51793 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCN4P51793 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCN4P51793 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCN4P51793 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCN4P51793 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCN4P51793 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCN4P51793 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCN4P51793 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCN4P51793 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCN4P51793 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCN4P51793 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCN4P51793 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCN4P51793 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCN4P51793 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCN4P51793 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCN4P51793 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCN4P51793 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCN4P51793 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCN4P51793 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCN4P51793 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCN4P51793 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCN4P51793 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCN4P51793 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCN4P51793 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCN4P51793 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCN4P51793 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCN4P51793 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCN4P51793 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCN4P51793 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCN4P51793 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms