Protein–RNA interactions for Protein: P51677

CCR3, C-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR3P51677 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCR3P51677 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR3P51677 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR3P51677 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR3P51677 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR3P51677 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR3P51677 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR3P51677 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCR3P51677 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR3P51677 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR3P51677 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR3P51677 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR3P51677 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR3P51677 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR3P51677 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR3P51677 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR3P51677 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR3P51677 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR3P51677 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR3P51677 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR3P51677 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR3P51677 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR3P51677 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR3P51677 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR3P51677 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR3P51677 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR3P51677 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR3P51677 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR3P51677 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR3P51677 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR3P51677 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR3P51677 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR3P51677 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR3P51677 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR3P51677 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR3P51677 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR3P51677 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR3P51677 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR3P51677 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR3P51677 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR3P51677 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR3P51677 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR3P51677 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR3P51677 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR3P51677 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR3P51677 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR3P51677 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR3P51677 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR3P51677 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR3P51677 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR3P51677 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR3P51677 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR3P51677 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR3P51677 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR3P51677 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR3P51677 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR3P51677 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR3P51677 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR3P51677 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCR3P51677 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCR3P51677 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCR3P51677 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCR3P51677 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCR3P51677 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCR3P51677 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR3P51677 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR3P51677 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR3P51677 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR3P51677 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR3P51677 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR3P51677 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR3P51677 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCR3P51677 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCR3P51677 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCR3P51677 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCR3P51677 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCR3P51677 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCR3P51677 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR3P51677 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR3P51677 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR3P51677 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR3P51677 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR3P51677 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR3P51677 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR3P51677 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR3P51677 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR3P51677 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR3P51677 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR3P51677 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR3P51677 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR3P51677 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR3P51677 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR3P51677 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCR3P51677 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCR3P51677 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCR3P51677 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCR3P51677 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCR3P51677 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCR3P51677 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCR3P51677 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms