Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBP50607 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBP50607 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBP50607 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBP50607 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBP50607 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBP50607 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBP50607 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBP50607 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBP50607 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBP50607 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBP50607 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBP50607 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBP50607 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBP50607 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBP50607 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBP50607 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBP50607 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBP50607 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBP50607 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBP50607 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBP50607 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBP50607 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBP50607 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBP50607 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBP50607 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBP50607 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBP50607 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBP50607 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBP50607 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBP50607 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBP50607 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBP50607 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBP50607 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBP50607 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBP50607 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBP50607 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBP50607 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBP50607 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBP50607 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBP50607 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBP50607 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBP50607 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBP50607 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBP50607 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBP50607 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBP50607 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBP50607 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBP50607 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBP50607 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBP50607 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBP50607 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBP50607 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBP50607 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBP50607 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBP50607 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBP50607 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBP50607 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBP50607 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBP50607 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBP50607 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBP50607 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBP50607 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBP50607 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBP50607 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBP50607 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBP50607 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBP50607 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBP50607 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBP50607 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBP50607 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBP50607 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBP50607 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBP50607 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBP50607 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBP50607 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBP50607 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBP50607 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBP50607 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBP50607 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBP50607 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBP50607 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBP50607 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBP50607 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBP50607 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBP50607 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBP50607 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBP50607 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBP50607 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBP50607 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBP50607 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBP50607 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBP50607 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBP50607 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBP50607 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBP50607 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBP50607 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBP50607 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBP50607 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBP50607 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms