Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CRIP1P50238 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.3 ms