Protein–RNA interactions for Protein: P49761

CLK3, Dual specificity protein kinase CLK3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK3P49761 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLK3P49761 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK3P49761 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK3P49761 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK3P49761 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK3P49761 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK3P49761 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK3P49761 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK3P49761 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK3P49761 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK3P49761 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK3P49761 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK3P49761 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK3P49761 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK3P49761 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLK3P49761 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLK3P49761 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLK3P49761 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLK3P49761 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLK3P49761 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLK3P49761 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLK3P49761 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLK3P49761 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLK3P49761 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLK3P49761 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLK3P49761 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLK3P49761 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLK3P49761 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLK3P49761 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLK3P49761 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLK3P49761 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLK3P49761 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLK3P49761 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLK3P49761 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLK3P49761 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK3P49761 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK3P49761 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK3P49761 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK3P49761 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK3P49761 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK3P49761 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK3P49761 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK3P49761 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK3P49761 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLK3P49761 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK3P49761 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK3P49761 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK3P49761 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK3P49761 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK3P49761 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK3P49761 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK3P49761 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK3P49761 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK3P49761 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK3P49761 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK3P49761 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLK3P49761 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLK3P49761 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLK3P49761 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLK3P49761 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLK3P49761 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLK3P49761 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLK3P49761 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLK3P49761 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLK3P49761 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLK3P49761 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK3P49761 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK3P49761 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK3P49761 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK3P49761 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK3P49761 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK3P49761 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK3P49761 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK3P49761 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK3P49761 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK3P49761 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK3P49761 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK3P49761 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK3P49761 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK3P49761 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK3P49761 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK3P49761 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK3P49761 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK3P49761 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK3P49761 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK3P49761 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK3P49761 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK3P49761 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLK3P49761 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLK3P49761 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLK3P49761 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLK3P49761 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLK3P49761 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLK3P49761 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLK3P49761 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLK3P49761 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLK3P49761 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLK3P49761 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLK3P49761 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLK3P49761 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms