Protein–RNA interactions for Protein: P49720

PSMB3, Proteasome subunit beta type-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB3P49720 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms