Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX1P48742 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX1P48742 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX1P48742 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX1P48742 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX1P48742 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LHX1P48742 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LHX1P48742 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LHX1P48742 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LHX1P48742 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LHX1P48742 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LHX1P48742 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LHX1P48742 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LHX1P48742 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LHX1P48742 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LHX1P48742 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LHX1P48742 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LHX1P48742 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LHX1P48742 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
LHX1P48742 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LHX1P48742 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LHX1P48742 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LHX1P48742 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LHX1P48742 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LHX1P48742 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX1P48742 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX1P48742 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX1P48742 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX1P48742 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LHX1P48742 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LHX1P48742 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LHX1P48742 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LHX1P48742 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LHX1P48742 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LHX1P48742 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LHX1P48742 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LHX1P48742 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LHX1P48742 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LHX1P48742 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LHX1P48742 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LHX1P48742 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LHX1P48742 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LHX1P48742 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LHX1P48742 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LHX1P48742 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LHX1P48742 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LHX1P48742 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LHX1P48742 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LHX1P48742 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LHX1P48742 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LHX1P48742 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LHX1P48742 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LHX1P48742 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LHX1P48742 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LHX1P48742 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LHX1P48742 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LHX1P48742 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LHX1P48742 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LHX1P48742 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LHX1P48742 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LHX1P48742 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LHX1P48742 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LHX1P48742 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LHX1P48742 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LHX1P48742 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LHX1P48742 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX1P48742 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX1P48742 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX1P48742 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX1P48742 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX1P48742 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX1P48742 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX1P48742 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX1P48742 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX1P48742 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX1P48742 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX1P48742 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX1P48742 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX1P48742 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX1P48742 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LHX1P48742 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LHX1P48742 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LHX1P48742 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LHX1P48742 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LHX1P48742 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LHX1P48742 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LHX1P48742 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LHX1P48742 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LHX1P48742 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LHX1P48742 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LHX1P48742 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LHX1P48742 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LHX1P48742 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LHX1P48742 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LHX1P48742 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LHX1P48742 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LHX1P48742 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX1P48742 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX1P48742 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX1P48742 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms