Protein–RNA interactions for Protein: P47992

XCL1, Lymphotactin, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL1P47992 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
XCL1P47992 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
XCL1P47992 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XCL1P47992 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XCL1P47992 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
XCL1P47992 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
XCL1P47992 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
XCL1P47992 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
XCL1P47992 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
XCL1P47992 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
XCL1P47992 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XCL1P47992 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
XCL1P47992 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
XCL1P47992 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XCL1P47992 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XCL1P47992 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
XCL1P47992 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL1P47992 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL1P47992 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL1P47992 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL1P47992 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL1P47992 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL1P47992 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL1P47992 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL1P47992 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL1P47992 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL1P47992 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL1P47992 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL1P47992 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL1P47992 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL1P47992 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL1P47992 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL1P47992 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCL1P47992 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCL1P47992 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCL1P47992 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCL1P47992 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCL1P47992 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
XCL1P47992 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCL1P47992 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCL1P47992 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCL1P47992 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCL1P47992 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCL1P47992 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL1P47992 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL1P47992 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL1P47992 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL1P47992 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL1P47992 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL1P47992 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL1P47992 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL1P47992 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL1P47992 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL1P47992 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL1P47992 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL1P47992 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL1P47992 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL1P47992 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL1P47992 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL1P47992 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL1P47992 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL1P47992 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL1P47992 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL1P47992 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL1P47992 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XCL1P47992 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XCL1P47992 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XCL1P47992 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XCL1P47992 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XCL1P47992 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
XCL1P47992 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XCL1P47992 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XCL1P47992 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XCL1P47992 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XCL1P47992 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
XCL1P47992 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
XCL1P47992 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
XCL1P47992 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
XCL1P47992 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XCL1P47992 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XCL1P47992 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XCL1P47992 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XCL1P47992 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XCL1P47992 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XCL1P47992 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XCL1P47992 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XCL1P47992 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XCL1P47992 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XCL1P47992 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XCL1P47992 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XCL1P47992 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XCL1P47992 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XCL1P47992 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XCL1P47992 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XCL1P47992 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XCL1P47992 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XCL1P47992 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XCL1P47992 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XCL1P47992 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XCL1P47992 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms