Protein–RNA interactions for Protein: P42773

CDKN2C, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2CP42773 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2CP42773 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2CP42773 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms