Protein–RNA interactions for Protein: P41271

NBL1, Neuroblastoma suppressor of tumorigenicity 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBL1P41271 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBL1P41271 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBL1P41271 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBL1P41271 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBL1P41271 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBL1P41271 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBL1P41271 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBL1P41271 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBL1P41271 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBL1P41271 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBL1P41271 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBL1P41271 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBL1P41271 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBL1P41271 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NBL1P41271 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBL1P41271 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBL1P41271 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBL1P41271 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBL1P41271 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBL1P41271 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBL1P41271 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBL1P41271 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBL1P41271 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBL1P41271 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBL1P41271 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBL1P41271 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBL1P41271 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBL1P41271 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBL1P41271 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBL1P41271 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBL1P41271 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NBL1P41271 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBL1P41271 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBL1P41271 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBL1P41271 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBL1P41271 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBL1P41271 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NBL1P41271 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBL1P41271 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBL1P41271 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBL1P41271 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBL1P41271 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBL1P41271 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBL1P41271 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBL1P41271 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBL1P41271 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NBL1P41271 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBL1P41271 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBL1P41271 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBL1P41271 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBL1P41271 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBL1P41271 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBL1P41271 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBL1P41271 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBL1P41271 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBL1P41271 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBL1P41271 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NBL1P41271 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NBL1P41271 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBL1P41271 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBL1P41271 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBL1P41271 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBL1P41271 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NBL1P41271 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBL1P41271 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NBL1P41271 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBL1P41271 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBL1P41271 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBL1P41271 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBL1P41271 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBL1P41271 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBL1P41271 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBL1P41271 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBL1P41271 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBL1P41271 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBL1P41271 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBL1P41271 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBL1P41271 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBL1P41271 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBL1P41271 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NBL1P41271 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBL1P41271 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBL1P41271 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBL1P41271 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBL1P41271 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBL1P41271 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBL1P41271 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBL1P41271 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBL1P41271 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NBL1P41271 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBL1P41271 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NBL1P41271 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBL1P41271 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBL1P41271 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBL1P41271 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBL1P41271 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBL1P41271 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBL1P41271 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBL1P41271 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBL1P41271 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms