Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.76■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
KDM5CP41229 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
KDM5CP41229 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
KDM5CP41229 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
KDM5CP41229 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
KDM5CP41229 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
KDM5CP41229 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
KDM5CP41229 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
KDM5CP41229 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
KDM5CP41229 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
KDM5CP41229 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
KDM5CP41229 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
KDM5CP41229 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
KDM5CP41229 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
KDM5CP41229 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
KDM5CP41229 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
KDM5CP41229 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
KDM5CP41229 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
KDM5CP41229 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
KDM5CP41229 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
KDM5CP41229 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
KDM5CP41229 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
KDM5CP41229 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
KDM5CP41229 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
KDM5CP41229 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
KDM5CP41229 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
KDM5CP41229 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
KDM5CP41229 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
KDM5CP41229 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
KDM5CP41229 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
KDM5CP41229 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
KDM5CP41229 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
KDM5CP41229 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
KDM5CP41229 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
KDM5CP41229 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM5CP41229 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM5CP41229 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM5CP41229 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM5CP41229 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM5CP41229 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
KDM5CP41229 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
KDM5CP41229 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
KDM5CP41229 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
KDM5CP41229 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
KDM5CP41229 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
KDM5CP41229 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
KDM5CP41229 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
KDM5CP41229 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
KDM5CP41229 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
KDM5CP41229 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
KDM5CP41229 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
KDM5CP41229 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
KDM5CP41229 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
KDM5CP41229 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
KDM5CP41229 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
KDM5CP41229 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
KDM5CP41229 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
KDM5CP41229 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
KDM5CP41229 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
KDM5CP41229 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
KDM5CP41229 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
KDM5CP41229 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
KDM5CP41229 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
KDM5CP41229 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
KDM5CP41229 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
KDM5CP41229 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
KDM5CP41229 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
KDM5CP41229 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
KDM5CP41229 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
KDM5CP41229 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
KDM5CP41229 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
KDM5CP41229 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
KDM5CP41229 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms