Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PBX1P40424 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PBX1P40424 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PBX1P40424 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PBX1P40424 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PBX1P40424 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PBX1P40424 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PBX1P40424 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PBX1P40424 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PBX1P40424 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PBX1P40424 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PBX1P40424 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PBX1P40424 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PBX1P40424 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PBX1P40424 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PBX1P40424 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PBX1P40424 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PBX1P40424 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PBX1P40424 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PBX1P40424 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PBX1P40424 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PBX1P40424 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PBX1P40424 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PBX1P40424 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PBX1P40424 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PBX1P40424 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PBX1P40424 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PBX1P40424 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PBX1P40424 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PBX1P40424 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PBX1P40424 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PBX1P40424 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PBX1P40424 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PBX1P40424 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PBX1P40424 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PBX1P40424 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PBX1P40424 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PBX1P40424 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PBX1P40424 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PBX1P40424 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PBX1P40424 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PBX1P40424 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PBX1P40424 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PBX1P40424 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PBX1P40424 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PBX1P40424 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBX1P40424 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBX1P40424 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBX1P40424 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBX1P40424 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBX1P40424 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBX1P40424 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBX1P40424 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBX1P40424 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PBX1P40424 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PBX1P40424 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PBX1P40424 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PBX1P40424 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PBX1P40424 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PBX1P40424 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PBX1P40424 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PBX1P40424 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBX1P40424 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBX1P40424 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBX1P40424 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBX1P40424 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBX1P40424 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBX1P40424 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBX1P40424 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBX1P40424 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PBX1P40424 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PBX1P40424 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PBX1P40424 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PBX1P40424 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBX1P40424 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBX1P40424 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBX1P40424 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBX1P40424 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBX1P40424 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBX1P40424 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBX1P40424 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBX1P40424 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBX1P40424 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBX1P40424 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBX1P40424 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBX1P40424 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBX1P40424 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBX1P40424 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PBX1P40424 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBX1P40424 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBX1P40424 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PBX1P40424 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PBX1P40424 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PBX1P40424 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PBX1P40424 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PBX1P40424 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PBX1P40424 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PBX1P40424 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PBX1P40424 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PBX1P40424 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms