Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ZEB1P37275 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ZEB1P37275 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ZEB1P37275 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ZEB1P37275 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ZEB1P37275 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
ZEB1P37275 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ZEB1P37275 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC34.68■■■■□ 3.14
ZEB1P37275 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ZEB1P37275 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ZEB1P37275 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ZEB1P37275 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ZEB1P37275 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ZEB1P37275 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ZEB1P37275 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ZEB1P37275 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ZEB1P37275 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
ZEB1P37275 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ZEB1P37275 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ZEB1P37275 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ZEB1P37275 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ZEB1P37275 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ZEB1P37275 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ZEB1P37275 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ZEB1P37275 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ZEB1P37275 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ZEB1P37275 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ZEB1P37275 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ZEB1P37275 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ZEB1P37275 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
ZEB1P37275 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms