Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NUP62P37198 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NUP62P37198 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NUP62P37198 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NUP62P37198 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NUP62P37198 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NUP62P37198 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NUP62P37198 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NUP62P37198 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NUP62P37198 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NUP62P37198 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NUP62P37198 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NUP62P37198 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NUP62P37198 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NUP62P37198 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NUP62P37198 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NUP62P37198 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NUP62P37198 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NUP62P37198 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NUP62P37198 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NUP62P37198 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NUP62P37198 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NUP62P37198 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NUP62P37198 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NUP62P37198 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NUP62P37198 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NUP62P37198 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NUP62P37198 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NUP62P37198 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NUP62P37198 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NUP62P37198 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NUP62P37198 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NUP62P37198 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NUP62P37198 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NUP62P37198 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NUP62P37198 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NUP62P37198 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NUP62P37198 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NUP62P37198 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP62P37198 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP62P37198 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP62P37198 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP62P37198 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP62P37198 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP62P37198 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP62P37198 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NUP62P37198 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP62P37198 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP62P37198 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP62P37198 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP62P37198 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP62P37198 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP62P37198 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP62P37198 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP62P37198 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP62P37198 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP62P37198 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP62P37198 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NUP62P37198 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP62P37198 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP62P37198 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP62P37198 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP62P37198 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP62P37198 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP62P37198 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP62P37198 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP62P37198 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP62P37198 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP62P37198 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP62P37198 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP62P37198 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP62P37198 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUP62P37198 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NUP62P37198 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NUP62P37198 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NUP62P37198 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NUP62P37198 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NUP62P37198 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NUP62P37198 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NUP62P37198 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NUP62P37198 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NUP62P37198 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NUP62P37198 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NUP62P37198 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NUP62P37198 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NUP62P37198 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NUP62P37198 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NUP62P37198 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NUP62P37198 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NUP62P37198 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NUP62P37198 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NUP62P37198 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NUP62P37198 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NUP62P37198 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NUP62P37198 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NUP62P37198 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NUP62P37198 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NUP62P37198 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NUP62P37198 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NUP62P37198 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms