Protein–RNA interactions for Protein: P35900

KRT20, Keratin, type I cytoskeletal 20, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT20P35900 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT20P35900 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT20P35900 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT20P35900 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT20P35900 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT20P35900 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT20P35900 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT20P35900 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT20P35900 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT20P35900 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT20P35900 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT20P35900 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT20P35900 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT20P35900 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT20P35900 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT20P35900 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT20P35900 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT20P35900 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT20P35900 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT20P35900 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT20P35900 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT20P35900 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT20P35900 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT20P35900 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT20P35900 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT20P35900 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT20P35900 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT20P35900 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT20P35900 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT20P35900 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT20P35900 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT20P35900 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT20P35900 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT20P35900 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT20P35900 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT20P35900 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT20P35900 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT20P35900 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT20P35900 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT20P35900 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT20P35900 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT20P35900 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT20P35900 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT20P35900 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT20P35900 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT20P35900 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT20P35900 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT20P35900 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT20P35900 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT20P35900 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT20P35900 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT20P35900 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT20P35900 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT20P35900 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT20P35900 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT20P35900 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT20P35900 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT20P35900 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT20P35900 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT20P35900 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT20P35900 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT20P35900 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT20P35900 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT20P35900 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT20P35900 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT20P35900 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT20P35900 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT20P35900 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT20P35900 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT20P35900 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT20P35900 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT20P35900 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT20P35900 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT20P35900 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT20P35900 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT20P35900 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT20P35900 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT20P35900 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT20P35900 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT20P35900 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT20P35900 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT20P35900 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT20P35900 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT20P35900 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT20P35900 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT20P35900 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT20P35900 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT20P35900 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT20P35900 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT20P35900 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT20P35900 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT20P35900 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT20P35900 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT20P35900 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KRT20P35900 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT20P35900 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT20P35900 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT20P35900 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT20P35900 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT20P35900 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms