Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP214P35658 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP214P35658 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP214P35658 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP214P35658 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP214P35658 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP214P35658 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP214P35658 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP214P35658 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP214P35658 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP214P35658 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP214P35658 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP214P35658 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP214P35658 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP214P35658 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP214P35658 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP214P35658 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP214P35658 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP214P35658 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP214P35658 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP214P35658 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP214P35658 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP214P35658 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP214P35658 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP214P35658 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP214P35658 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP214P35658 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP214P35658 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP214P35658 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP214P35658 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP214P35658 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP214P35658 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP214P35658 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP214P35658 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUP214P35658 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUP214P35658 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP214P35658 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP214P35658 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP214P35658 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP214P35658 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP214P35658 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP214P35658 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP214P35658 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP214P35658 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP214P35658 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP214P35658 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP214P35658 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP214P35658 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP214P35658 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP214P35658 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP214P35658 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP214P35658 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP214P35658 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP214P35658 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP214P35658 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP214P35658 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP214P35658 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP214P35658 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP214P35658 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP214P35658 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP214P35658 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP214P35658 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP214P35658 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP214P35658 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP214P35658 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP214P35658 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP214P35658 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP214P35658 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP214P35658 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP214P35658 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP214P35658 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP214P35658 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP214P35658 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP214P35658 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP214P35658 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP214P35658 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP214P35658 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP214P35658 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP214P35658 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP214P35658 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP214P35658 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP214P35658 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP214P35658 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP214P35658 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP214P35658 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP214P35658 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP214P35658 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP214P35658 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP214P35658 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP214P35658 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP214P35658 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP214P35658 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP214P35658 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP214P35658 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP214P35658 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP214P35658 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP214P35658 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP214P35658 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP214P35658 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP214P35658 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms