Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RORAP35398 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RORAP35398 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RORAP35398 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RORAP35398 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RORAP35398 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RORAP35398 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RORAP35398 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RORAP35398 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RORAP35398 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RORAP35398 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RORAP35398 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RORAP35398 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RORAP35398 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RORAP35398 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RORAP35398 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RORAP35398 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RORAP35398 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RORAP35398 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RORAP35398 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RORAP35398 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RORAP35398 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RORAP35398 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RORAP35398 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RORAP35398 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RORAP35398 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RORAP35398 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RORAP35398 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RORAP35398 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RORAP35398 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RORAP35398 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RORAP35398 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RORAP35398 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RORAP35398 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RORAP35398 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RORAP35398 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RORAP35398 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RORAP35398 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RORAP35398 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RORAP35398 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RORAP35398 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RORAP35398 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RORAP35398 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RORAP35398 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RORAP35398 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RORAP35398 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RORAP35398 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RORAP35398 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RORAP35398 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RORAP35398 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RORAP35398 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RORAP35398 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RORAP35398 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RORAP35398 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RORAP35398 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RORAP35398 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RORAP35398 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RORAP35398 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RORAP35398 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RORAP35398 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RORAP35398 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RORAP35398 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RORAP35398 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RORAP35398 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RORAP35398 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RORAP35398 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RORAP35398 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RORAP35398 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RORAP35398 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RORAP35398 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RORAP35398 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RORAP35398 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RORAP35398 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RORAP35398 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RORAP35398 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RORAP35398 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RORAP35398 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RORAP35398 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RORAP35398 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RORAP35398 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RORAP35398 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RORAP35398 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RORAP35398 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RORAP35398 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RORAP35398 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RORAP35398 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RORAP35398 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RORAP35398 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RORAP35398 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RORAP35398 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RORAP35398 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RORAP35398 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RORAP35398 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RORAP35398 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RORAP35398 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RORAP35398 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RORAP35398 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RORAP35398 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RORAP35398 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RORAP35398 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms