Protein–RNA interactions for Protein: P33947

KDELR2, ER lumen protein-retaining receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR2P33947 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KDELR2P33947 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KDELR2P33947 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KDELR2P33947 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KDELR2P33947 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDELR2P33947 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDELR2P33947 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDELR2P33947 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDELR2P33947 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDELR2P33947 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDELR2P33947 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDELR2P33947 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDELR2P33947 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDELR2P33947 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDELR2P33947 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDELR2P33947 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDELR2P33947 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDELR2P33947 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDELR2P33947 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDELR2P33947 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDELR2P33947 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDELR2P33947 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDELR2P33947 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDELR2P33947 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDELR2P33947 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDELR2P33947 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDELR2P33947 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDELR2P33947 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDELR2P33947 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KDELR2P33947 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDELR2P33947 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDELR2P33947 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDELR2P33947 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms