Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCR1P32246 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCR1P32246 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCR1P32246 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCR1P32246 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCR1P32246 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCR1P32246 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCR1P32246 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCR1P32246 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCR1P32246 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCR1P32246 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCR1P32246 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCR1P32246 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCR1P32246 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCR1P32246 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCR1P32246 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCR1P32246 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCR1P32246 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCR1P32246 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCR1P32246 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCR1P32246 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCR1P32246 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCR1P32246 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCR1P32246 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCR1P32246 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCR1P32246 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCR1P32246 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCR1P32246 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCR1P32246 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCR1P32246 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCR1P32246 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCR1P32246 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCR1P32246 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCR1P32246 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCR1P32246 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCR1P32246 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCR1P32246 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCR1P32246 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCR1P32246 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCR1P32246 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCR1P32246 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCR1P32246 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCR1P32246 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCR1P32246 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCR1P32246 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCR1P32246 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCR1P32246 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCR1P32246 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCR1P32246 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCR1P32246 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCR1P32246 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCR1P32246 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCR1P32246 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCR1P32246 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCR1P32246 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCR1P32246 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCR1P32246 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCR1P32246 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCR1P32246 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCR1P32246 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCR1P32246 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCR1P32246 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCR1P32246 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCR1P32246 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCR1P32246 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCR1P32246 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCR1P32246 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCR1P32246 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCR1P32246 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCR1P32246 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCR1P32246 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCR1P32246 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCR1P32246 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCR1P32246 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCR1P32246 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCR1P32246 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCR1P32246 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCR1P32246 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCR1P32246 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCR1P32246 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCR1P32246 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCR1P32246 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCR1P32246 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCR1P32246 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCR1P32246 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCR1P32246 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCR1P32246 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCR1P32246 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCR1P32246 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCR1P32246 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCR1P32246 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCR1P32246 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCR1P32246 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCR1P32246 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCR1P32246 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCR1P32246 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCR1P32246 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCR1P32246 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCR1P32246 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCR1P32246 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms