Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1CAMP32004 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1CAMP32004 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1CAMP32004 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1CAMP32004 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
L1CAMP32004 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
L1CAMP32004 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1CAMP32004 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1CAMP32004 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1CAMP32004 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1CAMP32004 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1CAMP32004 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1CAMP32004 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1CAMP32004 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1CAMP32004 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1CAMP32004 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1CAMP32004 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
L1CAMP32004 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
L1CAMP32004 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
L1CAMP32004 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
L1CAMP32004 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
L1CAMP32004 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
L1CAMP32004 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
L1CAMP32004 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
L1CAMP32004 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
L1CAMP32004 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
L1CAMP32004 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
L1CAMP32004 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
L1CAMP32004 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
L1CAMP32004 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
L1CAMP32004 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
L1CAMP32004 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
L1CAMP32004 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
L1CAMP32004 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
L1CAMP32004 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
L1CAMP32004 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
L1CAMP32004 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
L1CAMP32004 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
L1CAMP32004 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
L1CAMP32004 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
L1CAMP32004 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
L1CAMP32004 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
L1CAMP32004 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
L1CAMP32004 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
L1CAMP32004 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms