Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CMPK1P30085 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms