Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SERPINB3P29508 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms