Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID4AP29374 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID4AP29374 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID4AP29374 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID4AP29374 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID4AP29374 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID4AP29374 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARID4AP29374 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARID4AP29374 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARID4AP29374 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARID4AP29374 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARID4AP29374 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ARID4AP29374 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARID4AP29374 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARID4AP29374 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARID4AP29374 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms