Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNFRSF8P28908 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF8P28908 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms