Protein–RNA interactions for Protein: P28069

POU1F1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU1F1P28069 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POU1F1P28069 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POU1F1P28069 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms