Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLNP26678 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLNP26678 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLNP26678 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PLNP26678 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLNP26678 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLNP26678 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PLNP26678 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLNP26678 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLNP26678 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLNP26678 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLNP26678 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLNP26678 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLNP26678 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLNP26678 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLNP26678 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLNP26678 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLNP26678 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLNP26678 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLNP26678 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLNP26678 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLNP26678 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLNP26678 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLNP26678 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLNP26678 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLNP26678 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PLNP26678 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLNP26678 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLNP26678 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLNP26678 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLNP26678 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLNP26678 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLNP26678 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLNP26678 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLNP26678 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLNP26678 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLNP26678 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLNP26678 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLNP26678 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLNP26678 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLNP26678 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLNP26678 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLNP26678 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLNP26678 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLNP26678 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLNP26678 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLNP26678 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLNP26678 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLNP26678 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLNP26678 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLNP26678 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLNP26678 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLNP26678 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLNP26678 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLNP26678 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLNP26678 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLNP26678 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLNP26678 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLNP26678 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PLNP26678 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLNP26678 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLNP26678 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLNP26678 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLNP26678 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLNP26678 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLNP26678 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLNP26678 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLNP26678 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLNP26678 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLNP26678 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLNP26678 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLNP26678 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLNP26678 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLNP26678 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLNP26678 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLNP26678 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLNP26678 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLNP26678 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLNP26678 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLNP26678 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLNP26678 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLNP26678 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLNP26678 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLNP26678 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLNP26678 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLNP26678 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLNP26678 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLNP26678 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLNP26678 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLNP26678 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLNP26678 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLNP26678 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLNP26678 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLNP26678 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLNP26678 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLNP26678 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLNP26678 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLNP26678 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLNP26678 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLNP26678 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms