Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VARSP26640 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VARSP26640 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VARSP26640 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VARSP26640 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VARSP26640 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VARSP26640 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VARSP26640 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VARSP26640 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VARSP26640 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VARSP26640 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VARSP26640 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VARSP26640 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VARSP26640 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VARSP26640 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VARSP26640 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VARSP26640 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VARSP26640 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VARSP26640 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VARSP26640 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VARSP26640 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VARSP26640 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VARSP26640 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VARSP26640 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VARSP26640 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VARSP26640 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VARSP26640 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VARSP26640 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VARSP26640 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VARSP26640 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VARSP26640 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VARSP26640 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VARSP26640 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VARSP26640 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VARSP26640 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VARSP26640 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VARSP26640 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VARSP26640 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VARSP26640 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VARSP26640 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VARSP26640 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VARSP26640 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VARSP26640 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VARSP26640 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VARSP26640 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VARSP26640 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VARSP26640 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VARSP26640 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VARSP26640 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VARSP26640 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VARSP26640 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VARSP26640 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VARSP26640 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VARSP26640 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VARSP26640 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VARSP26640 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VARSP26640 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VARSP26640 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VARSP26640 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VARSP26640 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VARSP26640 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VARSP26640 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VARSP26640 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VARSP26640 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VARSP26640 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VARSP26640 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VARSP26640 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VARSP26640 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VARSP26640 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VARSP26640 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VARSP26640 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VARSP26640 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VARSP26640 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VARSP26640 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VARSP26640 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VARSP26640 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VARSP26640 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VARSP26640 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VARSP26640 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VARSP26640 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VARSP26640 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VARSP26640 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VARSP26640 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VARSP26640 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VARSP26640 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VARSP26640 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VARSP26640 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VARSP26640 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VARSP26640 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VARSP26640 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VARSP26640 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VARSP26640 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VARSP26640 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VARSP26640 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VARSP26640 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VARSP26640 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VARSP26640 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VARSP26640 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VARSP26640 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VARSP26640 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.3 ms