Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMA4P25789 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMA4P25789 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms