Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BGNP21810 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BGNP21810 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BGNP21810 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BGNP21810 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BGNP21810 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BGNP21810 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BGNP21810 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BGNP21810 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BGNP21810 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BGNP21810 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BGNP21810 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BGNP21810 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BGNP21810 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BGNP21810 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BGNP21810 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BGNP21810 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BGNP21810 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BGNP21810 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BGNP21810 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BGNP21810 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BGNP21810 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BGNP21810 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BGNP21810 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BGNP21810 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BGNP21810 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BGNP21810 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BGNP21810 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BGNP21810 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BGNP21810 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BGNP21810 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BGNP21810 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BGNP21810 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BGNP21810 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BGNP21810 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BGNP21810 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BGNP21810 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BGNP21810 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BGNP21810 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BGNP21810 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BGNP21810 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BGNP21810 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BGNP21810 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BGNP21810 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BGNP21810 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BGNP21810 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BGNP21810 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BGNP21810 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BGNP21810 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BGNP21810 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BGNP21810 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BGNP21810 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BGNP21810 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BGNP21810 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BGNP21810 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BGNP21810 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BGNP21810 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BGNP21810 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BGNP21810 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BGNP21810 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BGNP21810 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BGNP21810 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BGNP21810 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BGNP21810 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BGNP21810 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BGNP21810 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BGNP21810 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BGNP21810 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BGNP21810 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BGNP21810 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BGNP21810 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BGNP21810 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BGNP21810 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BGNP21810 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BGNP21810 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BGNP21810 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BGNP21810 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BGNP21810 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BGNP21810 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BGNP21810 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BGNP21810 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BGNP21810 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BGNP21810 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BGNP21810 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BGNP21810 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BGNP21810 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BGNP21810 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BGNP21810 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BGNP21810 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BGNP21810 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BGNP21810 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BGNP21810 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BGNP21810 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BGNP21810 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BGNP21810 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BGNP21810 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BGNP21810 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BGNP21810 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BGNP21810 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BGNP21810 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms