Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TFE3P19532 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFE3P19532 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFE3P19532 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFE3P19532 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFE3P19532 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFE3P19532 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFE3P19532 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TFE3P19532 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TFE3P19532 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TFE3P19532 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TFE3P19532 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFE3P19532 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFE3P19532 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFE3P19532 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFE3P19532 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFE3P19532 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFE3P19532 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFE3P19532 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFE3P19532 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFE3P19532 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFE3P19532 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFE3P19532 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFE3P19532 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFE3P19532 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFE3P19532 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFE3P19532 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFE3P19532 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFE3P19532 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFE3P19532 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFE3P19532 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFE3P19532 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFE3P19532 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFE3P19532 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFE3P19532 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TFE3P19532 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFE3P19532 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFE3P19532 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TFE3P19532 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TFE3P19532 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFE3P19532 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFE3P19532 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFE3P19532 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFE3P19532 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFE3P19532 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFE3P19532 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TFE3P19532 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TFE3P19532 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TFE3P19532 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TFE3P19532 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFE3P19532 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFE3P19532 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFE3P19532 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFE3P19532 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFE3P19532 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFE3P19532 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFE3P19532 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFE3P19532 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFE3P19532 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TFE3P19532 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFE3P19532 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFE3P19532 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFE3P19532 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFE3P19532 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFE3P19532 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFE3P19532 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFE3P19532 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFE3P19532 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFE3P19532 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFE3P19532 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFE3P19532 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFE3P19532 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TFE3P19532 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFE3P19532 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFE3P19532 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFE3P19532 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFE3P19532 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFE3P19532 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFE3P19532 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFE3P19532 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFE3P19532 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFE3P19532 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFE3P19532 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFE3P19532 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFE3P19532 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFE3P19532 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFE3P19532 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFE3P19532 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFE3P19532 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFE3P19532 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFE3P19532 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFE3P19532 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFE3P19532 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFE3P19532 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFE3P19532 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TFE3P19532 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TFE3P19532 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TFE3P19532 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TFE3P19532 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TFE3P19532 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms