Protein–RNA interactions for Protein: P19419

ELK1, ETS domain-containing protein Elk-1, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK1P19419 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ELK1P19419 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ELK1P19419 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ELK1P19419 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ELK1P19419 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ELK1P19419 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ELK1P19419 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELK1P19419 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELK1P19419 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELK1P19419 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELK1P19419 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELK1P19419 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELK1P19419 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELK1P19419 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELK1P19419 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELK1P19419 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELK1P19419 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELK1P19419 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELK1P19419 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELK1P19419 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELK1P19419 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELK1P19419 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELK1P19419 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ELK1P19419 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELK1P19419 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELK1P19419 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELK1P19419 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELK1P19419 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELK1P19419 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELK1P19419 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELK1P19419 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELK1P19419 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELK1P19419 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELK1P19419 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELK1P19419 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELK1P19419 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELK1P19419 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELK1P19419 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELK1P19419 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ELK1P19419 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELK1P19419 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELK1P19419 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELK1P19419 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELK1P19419 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELK1P19419 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELK1P19419 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELK1P19419 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELK1P19419 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELK1P19419 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELK1P19419 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELK1P19419 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELK1P19419 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELK1P19419 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ELK1P19419 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELK1P19419 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELK1P19419 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELK1P19419 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELK1P19419 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELK1P19419 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELK1P19419 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELK1P19419 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELK1P19419 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELK1P19419 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELK1P19419 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELK1P19419 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELK1P19419 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELK1P19419 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ELK1P19419 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ELK1P19419 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ELK1P19419 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ELK1P19419 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELK1P19419 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ELK1P19419 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELK1P19419 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELK1P19419 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ELK1P19419 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELK1P19419 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELK1P19419 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELK1P19419 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELK1P19419 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELK1P19419 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELK1P19419 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELK1P19419 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELK1P19419 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELK1P19419 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELK1P19419 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELK1P19419 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELK1P19419 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELK1P19419 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELK1P19419 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELK1P19419 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELK1P19419 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELK1P19419 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELK1P19419 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ELK1P19419 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELK1P19419 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELK1P19419 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELK1P19419 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELK1P19419 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELK1P19419 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms