Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDCP19113 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDCP19113 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDCP19113 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDCP19113 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDCP19113 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDCP19113 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDCP19113 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDCP19113 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HDCP19113 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDCP19113 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDCP19113 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDCP19113 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDCP19113 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDCP19113 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDCP19113 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDCP19113 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDCP19113 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HDCP19113 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDCP19113 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDCP19113 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDCP19113 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HDCP19113 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDCP19113 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDCP19113 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDCP19113 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDCP19113 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDCP19113 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDCP19113 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDCP19113 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDCP19113 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDCP19113 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDCP19113 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDCP19113 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDCP19113 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDCP19113 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDCP19113 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDCP19113 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HDCP19113 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDCP19113 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDCP19113 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDCP19113 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDCP19113 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDCP19113 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDCP19113 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDCP19113 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDCP19113 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDCP19113 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDCP19113 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDCP19113 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDCP19113 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDCP19113 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDCP19113 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDCP19113 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDCP19113 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDCP19113 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDCP19113 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDCP19113 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDCP19113 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDCP19113 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDCP19113 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDCP19113 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDCP19113 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDCP19113 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDCP19113 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDCP19113 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDCP19113 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDCP19113 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDCP19113 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDCP19113 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDCP19113 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDCP19113 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDCP19113 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDCP19113 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDCP19113 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDCP19113 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDCP19113 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDCP19113 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDCP19113 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDCP19113 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDCP19113 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDCP19113 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HDCP19113 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HDCP19113 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HDCP19113 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDCP19113 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDCP19113 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDCP19113 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDCP19113 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDCP19113 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDCP19113 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDCP19113 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDCP19113 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDCP19113 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDCP19113 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDCP19113 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDCP19113 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDCP19113 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDCP19113 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDCP19113 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms