Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT4P19013 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT4P19013 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT4P19013 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT4P19013 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT4P19013 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT4P19013 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT4P19013 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT4P19013 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT4P19013 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT4P19013 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT4P19013 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT4P19013 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT4P19013 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT4P19013 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT4P19013 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT4P19013 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT4P19013 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT4P19013 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT4P19013 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT4P19013 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT4P19013 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT4P19013 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT4P19013 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT4P19013 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT4P19013 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT4P19013 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT4P19013 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT4P19013 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT4P19013 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT4P19013 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT4P19013 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT4P19013 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT4P19013 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT4P19013 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT4P19013 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT4P19013 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT4P19013 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT4P19013 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT4P19013 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT4P19013 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT4P19013 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT4P19013 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT4P19013 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT4P19013 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT4P19013 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT4P19013 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT4P19013 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT4P19013 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT4P19013 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT4P19013 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT4P19013 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT4P19013 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT4P19013 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT4P19013 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT4P19013 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT4P19013 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT4P19013 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT4P19013 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT4P19013 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT4P19013 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT4P19013 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT4P19013 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT4P19013 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT4P19013 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT4P19013 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT4P19013 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT4P19013 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT4P19013 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT4P19013 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT4P19013 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT4P19013 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT4P19013 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT4P19013 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT4P19013 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT4P19013 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT4P19013 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT4P19013 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT4P19013 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT4P19013 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT4P19013 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT4P19013 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT4P19013 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT4P19013 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT4P19013 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT4P19013 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT4P19013 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT4P19013 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT4P19013 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT4P19013 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT4P19013 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT4P19013 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT4P19013 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT4P19013 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT4P19013 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT4P19013 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT4P19013 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT4P19013 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT4P19013 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT4P19013 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms