Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFRAP16234 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 316.2 ms