Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VEGFAP15692 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VEGFAP15692 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VEGFAP15692 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VEGFAP15692 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VEGFAP15692 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VEGFAP15692 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VEGFAP15692 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VEGFAP15692 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VEGFAP15692 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VEGFAP15692 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VEGFAP15692 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VEGFAP15692 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VEGFAP15692 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VEGFAP15692 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VEGFAP15692 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VEGFAP15692 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VEGFAP15692 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
VEGFAP15692 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VEGFAP15692 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VEGFAP15692 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
VEGFAP15692 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VEGFAP15692 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VEGFAP15692 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VEGFAP15692 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VEGFAP15692 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VEGFAP15692 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VEGFAP15692 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VEGFAP15692 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VEGFAP15692 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VEGFAP15692 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VEGFAP15692 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VEGFAP15692 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VEGFAP15692 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VEGFAP15692 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VEGFAP15692 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VEGFAP15692 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VEGFAP15692 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VEGFAP15692 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VEGFAP15692 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VEGFAP15692 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VEGFAP15692 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VEGFAP15692 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VEGFAP15692 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
VEGFAP15692 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
VEGFAP15692 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
VEGFAP15692 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms