Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAV1P15498 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAV1P15498 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAV1P15498 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAV1P15498 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAV1P15498 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAV1P15498 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAV1P15498 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAV1P15498 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VAV1P15498 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAV1P15498 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAV1P15498 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAV1P15498 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAV1P15498 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAV1P15498 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VAV1P15498 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAV1P15498 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAV1P15498 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAV1P15498 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAV1P15498 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAV1P15498 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAV1P15498 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAV1P15498 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAV1P15498 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAV1P15498 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAV1P15498 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAV1P15498 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAV1P15498 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAV1P15498 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VAV1P15498 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAV1P15498 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAV1P15498 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAV1P15498 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAV1P15498 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAV1P15498 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAV1P15498 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VAV1P15498 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAV1P15498 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAV1P15498 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAV1P15498 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAV1P15498 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAV1P15498 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAV1P15498 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAV1P15498 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAV1P15498 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAV1P15498 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAV1P15498 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAV1P15498 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAV1P15498 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VAV1P15498 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAV1P15498 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAV1P15498 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAV1P15498 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAV1P15498 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAV1P15498 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAV1P15498 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAV1P15498 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAV1P15498 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAV1P15498 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAV1P15498 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAV1P15498 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAV1P15498 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAV1P15498 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAV1P15498 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAV1P15498 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAV1P15498 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAV1P15498 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAV1P15498 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAV1P15498 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAV1P15498 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAV1P15498 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAV1P15498 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAV1P15498 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAV1P15498 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAV1P15498 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAV1P15498 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAV1P15498 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAV1P15498 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAV1P15498 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAV1P15498 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VAV1P15498 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAV1P15498 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAV1P15498 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAV1P15498 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAV1P15498 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAV1P15498 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAV1P15498 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAV1P15498 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VAV1P15498 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAV1P15498 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAV1P15498 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAV1P15498 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAV1P15498 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAV1P15498 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAV1P15498 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VAV1P15498 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAV1P15498 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAV1P15498 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAV1P15498 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAV1P15498 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms