Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms