Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEACAM1P13688 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEACAM1P13688 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEACAM1P13688 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEACAM1P13688 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEACAM1P13688 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEACAM1P13688 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEACAM1P13688 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEACAM1P13688 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEACAM1P13688 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEACAM1P13688 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEACAM1P13688 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEACAM1P13688 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEACAM1P13688 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM1P13688 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEACAM1P13688 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEACAM1P13688 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms