Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARGP13631 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARGP13631 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARGP13631 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARGP13631 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARGP13631 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RARGP13631 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RARGP13631 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARGP13631 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARGP13631 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARGP13631 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RARGP13631 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARGP13631 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARGP13631 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARGP13631 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARGP13631 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARGP13631 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RARGP13631 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARGP13631 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARGP13631 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARGP13631 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARGP13631 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RARGP13631 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARGP13631 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARGP13631 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARGP13631 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARGP13631 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARGP13631 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARGP13631 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARGP13631 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARGP13631 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARGP13631 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARGP13631 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARGP13631 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARGP13631 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARGP13631 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARGP13631 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARGP13631 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARGP13631 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARGP13631 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARGP13631 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARGP13631 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARGP13631 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARGP13631 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARGP13631 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARGP13631 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARGP13631 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARGP13631 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RARGP13631 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARGP13631 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARGP13631 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARGP13631 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARGP13631 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RARGP13631 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARGP13631 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RARGP13631 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
RARGP13631 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RARGP13631 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RARGP13631 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RARGP13631 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RARGP13631 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RARGP13631 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RARGP13631 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RARGP13631 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RARGP13631 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RARGP13631 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RARGP13631 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RARGP13631 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARGP13631 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARGP13631 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARGP13631 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARGP13631 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARGP13631 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARGP13631 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARGP13631 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARGP13631 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RARGP13631 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARGP13631 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARGP13631 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARGP13631 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARGP13631 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARGP13631 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RARGP13631 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARGP13631 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARGP13631 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARGP13631 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARGP13631 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RARGP13631 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARGP13631 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARGP13631 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARGP13631 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARGP13631 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARGP13631 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARGP13631 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARGP13631 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARGP13631 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARGP13631 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARGP13631 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARGP13631 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARGP13631 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms