Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA4P13612 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA4P13612 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms