Protein–RNA interactions for Protein: P12694

BCKDHA, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHAP12694 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCKDHAP12694 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCKDHAP12694 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCKDHAP12694 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCKDHAP12694 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCKDHAP12694 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCKDHAP12694 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCKDHAP12694 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCKDHAP12694 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCKDHAP12694 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCKDHAP12694 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCKDHAP12694 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCKDHAP12694 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDHAP12694 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDHAP12694 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDHAP12694 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDHAP12694 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDHAP12694 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms