Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRM1P11229 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms