Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD8BP10966 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD8BP10966 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CD8BP10966 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD8BP10966 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD8BP10966 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD8BP10966 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD8BP10966 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD8BP10966 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD8BP10966 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CD8BP10966 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD8BP10966 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD8BP10966 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD8BP10966 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD8BP10966 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD8BP10966 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD8BP10966 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD8BP10966 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD8BP10966 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD8BP10966 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD8BP10966 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD8BP10966 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD8BP10966 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD8BP10966 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD8BP10966 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD8BP10966 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD8BP10966 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD8BP10966 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD8BP10966 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD8BP10966 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD8BP10966 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD8BP10966 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD8BP10966 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD8BP10966 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD8BP10966 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD8BP10966 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD8BP10966 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD8BP10966 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD8BP10966 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD8BP10966 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD8BP10966 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD8BP10966 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD8BP10966 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CD8BP10966 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD8BP10966 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD8BP10966 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD8BP10966 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD8BP10966 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD8BP10966 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD8BP10966 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD8BP10966 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD8BP10966 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD8BP10966 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD8BP10966 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD8BP10966 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD8BP10966 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD8BP10966 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD8BP10966 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD8BP10966 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD8BP10966 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD8BP10966 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD8BP10966 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD8BP10966 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD8BP10966 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD8BP10966 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD8BP10966 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD8BP10966 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CD8BP10966 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD8BP10966 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD8BP10966 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD8BP10966 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD8BP10966 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD8BP10966 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD8BP10966 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD8BP10966 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CD8BP10966 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD8BP10966 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CD8BP10966 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD8BP10966 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD8BP10966 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CD8BP10966 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD8BP10966 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD8BP10966 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD8BP10966 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD8BP10966 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD8BP10966 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CD8BP10966 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD8BP10966 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD8BP10966 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD8BP10966 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD8BP10966 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CD8BP10966 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD8BP10966 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD8BP10966 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD8BP10966 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CD8BP10966 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD8BP10966 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CD8BP10966 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CD8BP10966 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CD8BP10966 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms