Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RARAP10276 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RARAP10276 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RARAP10276 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RARAP10276 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RARAP10276 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RARAP10276 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RARAP10276 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RARAP10276 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RARAP10276 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RARAP10276 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RARAP10276 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RARAP10276 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RARAP10276 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RARAP10276 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARAP10276 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARAP10276 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARAP10276 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARAP10276 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARAP10276 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARAP10276 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARAP10276 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARAP10276 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARAP10276 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARAP10276 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RARAP10276 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RARAP10276 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RARAP10276 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RARAP10276 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RARAP10276 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RARAP10276 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RARAP10276 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RARAP10276 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RARAP10276 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARAP10276 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARAP10276 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RARAP10276 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARAP10276 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARAP10276 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARAP10276 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RARAP10276 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RARAP10276 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RARAP10276 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RARAP10276 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RARAP10276 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RARAP10276 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RARAP10276 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RARAP10276 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RARAP10276 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARAP10276 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARAP10276 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARAP10276 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARAP10276 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARAP10276 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RARAP10276 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARAP10276 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARAP10276 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARAP10276 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARAP10276 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARAP10276 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARAP10276 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARAP10276 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARAP10276 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARAP10276 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARAP10276 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARAP10276 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARAP10276 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARAP10276 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARAP10276 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RARAP10276 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RARAP10276 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RARAP10276 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARAP10276 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARAP10276 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARAP10276 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARAP10276 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARAP10276 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARAP10276 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RARAP10276 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARAP10276 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RARAP10276 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARAP10276 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RARAP10276 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RARAP10276 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RARAP10276 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RARAP10276 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RARAP10276 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RARAP10276 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RARAP10276 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RARAP10276 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RARAP10276 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RARAP10276 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RARAP10276 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RARAP10276 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RARAP10276 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARAP10276 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARAP10276 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARAP10276 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARAP10276 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARAP10276 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms