Protein–RNA interactions for Protein: P0CG40

SP9, Transcription factor Sp9, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP9P0CG40 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP9P0CG40 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SP9P0CG40 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP9P0CG40 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP9P0CG40 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP9P0CG40 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP9P0CG40 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP9P0CG40 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP9P0CG40 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP9P0CG40 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP9P0CG40 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP9P0CG40 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms