Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLTAP09496 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CLTAP09496 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CLTAP09496 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLTAP09496 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLTAP09496 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLTAP09496 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLTAP09496 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLTAP09496 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLTAP09496 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLTAP09496 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLTAP09496 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLTAP09496 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLTAP09496 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLTAP09496 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLTAP09496 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLTAP09496 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLTAP09496 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLTAP09496 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLTAP09496 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLTAP09496 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CLTAP09496 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLTAP09496 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLTAP09496 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLTAP09496 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLTAP09496 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLTAP09496 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLTAP09496 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLTAP09496 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLTAP09496 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLTAP09496 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLTAP09496 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CLTAP09496 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLTAP09496 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLTAP09496 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLTAP09496 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLTAP09496 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLTAP09496 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLTAP09496 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLTAP09496 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLTAP09496 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLTAP09496 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLTAP09496 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLTAP09496 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLTAP09496 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CLTAP09496 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLTAP09496 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLTAP09496 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLTAP09496 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLTAP09496 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLTAP09496 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLTAP09496 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLTAP09496 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLTAP09496 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLTAP09496 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLTAP09496 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLTAP09496 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CLTAP09496 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLTAP09496 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLTAP09496 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTAP09496 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTAP09496 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTAP09496 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTAP09496 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTAP09496 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTAP09496 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTAP09496 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTAP09496 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTAP09496 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CLTAP09496 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLTAP09496 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLTAP09496 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLTAP09496 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLTAP09496 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLTAP09496 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLTAP09496 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLTAP09496 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLTAP09496 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLTAP09496 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLTAP09496 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLTAP09496 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLTAP09496 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTAP09496 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTAP09496 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTAP09496 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTAP09496 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTAP09496 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTAP09496 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTAP09496 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTAP09496 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
CLTAP09496 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLTAP09496 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLTAP09496 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLTAP09496 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLTAP09496 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLTAP09496 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLTAP09496 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLTAP09496 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLTAP09496 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLTAP09496 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
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